《中华儿科杂志》2026年第8期发表了由中华医学会儿科学分会感染学组、中华医学会肠外肠内营养学分会肠道微生态协作组等联合制定的《儿童肠菌移植临床应用管理专家共识（2026）》，旨在为儿科疾病提供规范的循证菌群干预方案。

适应证方面，复发性或难治性艰难梭菌感染（CDI）者，常规治疗无效并以腹胀、腹泻、腹痛或便秘为主要表现的功能性胃肠病者，多重耐药菌感染或定植且经筛查已排除肠源性感染风险者，推荐肠菌移植治疗；对于激素难治性或激素依赖的肠道移植物抗宿主病（GVHD）患儿，建议二、三线药物治疗的同时行肠菌移植治疗；对于传统药物、免疫抑制剂、生物制剂治疗应答不佳或继发失应答的炎症性肠病（IBD）患儿，以及常规治疗无效的难治性过敏性疾病患儿，可考虑肠菌移植治疗。禁忌证包括原发或获得性免疫缺陷病、肠梗阻、消化道穿孔、活动性消化道出血、中毒性巨结肠等。

供体筛选与管理方面，优先选择18~35岁健康成人供体；若需选用儿童供体，建议以亲属间捐赠为主。合格供体筛选需包括个人信息、内外科体格检查、血液学检查、粪便常规及病原学检查、尿常规、心理评估、饮食及生活习惯评估等。建议通过粪便16S核糖体RNA测序或宏基因组分析评估供体肠道菌群。过敏性疾病需行肠菌移植的儿童，建议供体进行回避过敏原饮食至少1周。推荐持续捐赠的成人供体每2个月进行1次全面评估，儿童供体每半年进行1次全面评估、每2个月进行1次粪便检查。

围移植期管理方面，移植前应对受体进行全面评估，包括营养状况、饮食、免疫功能及基础疾病控制情况。移植前3 d根据疾病类型酌情采用抗生素预处理，移植前24 h采用灌肠或复方聚乙二醇3350电解质散进行肠道清洁。移植途径包括上中消化道（鼻-空肠管、胃镜）、下消化道（结肠镜、保留灌肠等）及口服肠菌胶囊。单次推荐用量为每公斤体重1~2 g粪便制备成的菌液或胶囊，<3岁患儿酌情减量或分次进行，体重≥40 kg儿童按成人剂量，一般不超过50 g粪便制备的菌液或胶囊。采取下消化道途径者需抬高臀部，保持头低脚高侧卧位至少2 h。多次治疗的临床获益优于单次。疗效评估应根据疾病种类进行，包括临床评估和微生态评估，必要时行内镜评估。